Boss Survival -moodi ja Casting Theater: Läpäise seikkailu millä tahansa vaikeustasolla.
European Extreme -vaikeustaso: Läpäise seikkailu Normal-vaikeustasolla.
Valokuvamoodi VR-tehtäviin: Läpäise Bomb Disposal, Hold Up ja Eliminate -moodit.
Ninja Raiden: Läpäise 50% VR-tehtävistä Raidenilla.
Raiden X: Läpäise 100% VR-tehtävistä Raidenilla ja Ninja Raidenilla.
Pliskin: Läpäise 50% VR-tehtävistä Snakella.
Tuxedo Snake: Läpäise 100% VR-tehtävistä Pliskinillä.
Metal Gear Solid 1 Snake: Läpäise 100% VR-tehtävistä Snakella, Pliskinillä, Tuxedo Snakella, Raidenilla, Ninja Raidenilla ja Raiden X:llä.
Aurinkolasit: Läpäise seikkailu kaksi kertaa.
Stealth, Bandanna ja Wig -bonukset: Saat Stealthin ja Bandannan, kun läpäiset tankkerin Snakella kolme kertaa eri vaikeustasolla ja keräät kaikki tunnuslevyt. Saat Stealthin ja Wigin, kun läpäiset tehtaan Raidenilla kolme kertaa eri vaikeustasolla ja keräät kaikki tunnuslevyt. Tallenna läpäisyt samaan tiedostoon. Stealth on näkymättömyysbonus. Bandanna ja Wig antavat sankareille rajattomat ammukset. Kerää 170 tunnuslevyä ja saat tankkerikappaleeseen Orange Wig -bonuksen, joka antaa Raidenille rajattoman roikkumisvoiman.
Digitaalikamera: Läpäise seikkailu ja aloita uusi peli. Kamera on lautan Strut E Shell 1 -osassa. Suuntaa ruudun alalaitaan ja mene kolmella punavalolla merkatun tason luokse. Kiipeä sen päälle ja ota Z.O.E.-laatikko esiin. Kun liukuhihna pysähtyy, kiipeä ylöspäin. Sankari siirtyy toiseen huoneeseen. Hyppää pois hihnalta ja nappaa kamera.
Vaihtoehtoinen loppu: Läpäise Snake Tale ja saat M9:n. Aloita seikkailu ja tyrmää pomot M9:llä tappamisen sijaan.
